建研集团原实际控制人为自然人蔡永太先生、李晓斌先生、麻秀星女士、黄明辉先生、叶斌先生、郭元强先生、林燕妮女士和林千宇女士等共8人，合计持有公司股份74,779,880股，占公司现有股本总额的36.874%。其中，蔡永太担任董事长兼总裁、李晓斌担任董事兼副总裁、麻秀星担任董事兼副总裁、黄明辉担任副总裁、叶斌担任董事、林燕妮担任监事会主席、郭元强担任监事、林千宇担任财务总监。自2004年公司设立以来，上述8人实际控制着公司的经营决策与管理，并于2007年10月9日签订了《一致行动人协议书》，同意在公司的股东大会运作中采取一致行动（包括但不限于行使表决权），有效期限为：（1）自协议生效之日起至公司上市满三年（若公司在2009年12月31日前获准上市）；（2）自协议生效之日起满五年（若公司在2009年12月31日前未获准上市）。鉴于公司于2010年5月上市，因此，该协议的有效期限为自协议生效之日起满五年，即截至2012年10月9日到期终止。除了协议共同控制公司外，上述8人之间不存在关联关系。
    公司于2012年10月15日收到上述8位原公司实际控制人提交的《关于共同控制关系变动的声明与承诺函》。根据该函，原公司实际控制人自然人蔡永太先生、李晓斌先生、麻秀星女士、黄明辉先生、叶斌先生、郭元强先生、林燕妮女士和林千宇女士等共8人共同声明：自2012年10月15日起不再续签《一致行动人协议书》，因此，上述8位股东对公司的共同控制关系解除。
    目前，持有公司股份的前三大股东中，蔡永太先生持有17.71%股份，李晓斌先生持有5.32%股份，黄明辉先生持有5.08%股份。随着共同控制关系的解除，第一大股东蔡永太先生仍然实际控制着公司，为公司单一实际控制人。
    公司实际控制人蔡永太先生在《厦门市建筑科学研究院集团股份有限公司详式权益变动报告书》中表示：不排除在未来12个月内增加其在上市公司中拥有权益的股份的可能性。蔡永太先生签署的《厦门市建筑科学研究院集团股份有限公司详式权益变动报告书》同时刊载于巨潮资讯网。