县级公立医院改革的重要性：选择县级公立医院作为是因为县级医院利益相对简单、体量相对较小，通过“农村包围城市”般的改革路径更有利于整个公立医院改革的推进；另一方面，国家强调强基层、保基本，作为医疗网络中承上启下的一环，县级医院具有重要的作用，通过改革明确减轻群众负担。
　　《通知》是以往文件的深化：三部门6月份已经发布了《关于县级公立医院综合改革试点意见的通知》，此次通知内容是对原先的深化，说明了对县级医院改革的重视。通知明确提出按照建机制、控费用、调结构、强监管的原则，通过取消药品加成、调整医疗服务价格、改革收付费方式和落实政府办医责任等，破除“以药补医”机制，降低群众医药费用负担，为2015年实现县级公立医院阶段性改革目标打好基础。
　　总量控制、结构调整：即控制整体的医疗费用增长，在此基础上调整药品、医疗服务的收入结构；医疗费用的控制考虑经济发展水平、群众承受能力和基本医疗保障承受能力等因素；收入结构的调整初衷在于破除“以药补医”的机制，通过提高医疗服务的定价体现医生的价值，取消药品加成斩断医院与药品的利益。但需要强调的是，取消加成并没有斩断医生与药品的利益，医生仍然可以通过处方与药品实现利益挂钩，因此，政策的成功在于保证医生合理利益的基础上加大监管、惩治力度。取消试点医院药品加成政策：明确提出要确保试点公立医院的药品价格降低15%左右；坚持公立医院公益性质，切实加大财政投入。
　　调整医疗服务价格：明确与取消药品加成政策、增加政府投入同步推进，确保改革后群众医药费用负担有所减轻。在改革试点期间，医疗服务价格调整的权利在县、市（由省授权）；积极推进医疗服务定价方式改革：改革医疗服务以项目为主的定价方式，积极开展按病种、按服务单元等收费试点工作；要研究制定适应基本医疗需求的常见病、多发病的临床路径；加强医药价格监管，并强化医药费用控制：加强药品出厂价格调查和监测，严厉打击医药购销中各种回扣和非法折扣行为；抑制不合理使用药械以及过度检查和诊疗行为，将门（急）诊次均费用、住院床日费用、出院者平均医疗费用、药占比、总费用增长率等纳入县级公立医院目标管理责任制和绩效考核目标。