1927年生于上海。1951年毕业于清华大学物理系。
中国科学院院士，北京大学兼职教授、科学技术哲学专业博士生导师，中国科学院理论物理研究所研究员、理论物理专业博士研究生导师。第八、九届全国政协委员。早期从事粒子理论、原子弹和氢弹理论的研究。关注科学领域中的哲学问题，近十几年来关注社会现实问题，近年来积极参加捍卫科学尊严、揭露和反对伪科学等活动。(以上用楷体)
身为中科院院士，何祚庥的专业成就在于理论物理研究。但是，多年来他对伪气功、伪科学、能源问题、克隆、磁悬浮列车等等都大放其炮，使他成为了一个争议角色。
对何祚庥的批评很多，大而化之的，像不务正业、不宽容；具体一点的，如打压环保、爱给人“扣帽子”，甚至质疑他的院士资格。支持何祚庥的一方，则强硬反驳这些批评是把何祚庥“妖魔化”。
四面出击使何祚庥树敌颇多，有人把他列为当今“四大恶人”之一，称为“穷凶极恶”何祚庥。何祚庥对此不怎么在乎：“骂就骂吧。”
杨贵妃婚前是不是处女？
上世纪50年代初，历史学家陈寅恪考证“杨贵妃和唐明皇结婚前是不是处女”的问题，何祚庥觉得很无聊，后来他终于明白了这件事的意义，明白了自己“学马克思主义学得不好”。(本段提要)
何祚庥成长在上海的一个封建知识分子家庭，上的学校每周都有牧师来布道，但何祚庥很快就从这种环境里蜕变了。
何祚庥幼年时看驰名民国的旧武侠小说《蜀山剑侠传》，里面的侠客左脚踩在右脚上，然后右脚又踩在左脚上，轮流跳跃，可以一直跳上天空。何祚庥锲而不舍地照此办理，但并没有一次和侠客一样跳上天空。
类似的神奇功夫，在几十年后的新武侠小说代表作家之一梁羽生的作品里也出现过。以后学了力学，对这样的描述何祚庥自然一笑了之。而在这些早年的记忆中，大约就埋下了何祚庥对事物追究争辩的萌芽。
上世纪50年代初，从清华大学物理系毕业的何祚庥在中宣部科学卫生处工作。当时正值各种思潮交锋，何祚庥一次看见历史学家陈寅恪的一篇文章，觉得是个批评的好材料。在这篇长文中，陈寅恪以学者的严谨态度，不厌烦琐地考证杨贵妃和唐明皇结婚前是不是处女，结论是：不是处女。
何祚庥觉得这太可笑了：这些资产阶级学者无聊到了这个程度。何祚庥把这个材料汇报了上去，不料他的领导许力群给了他一个意外：小何，你不对，这是重要科学工作。
众所周知，杨贵妃嫁给唐明皇前是唐明皇儿子寿王的夫人，这本是公公娶了儿媳妇的丑闻。有封建史学家为了替尊者讳，说杨贵妃和寿王没有实质夫妻关系。许力群以为，陈寅恪的考证既暴露了封建帝王的荒淫无耻，又揭露了封建史学家的无聊和无耻，所以这篇文章是重要的反封建史学考证。
这件事情带有鲜明的那个时代的意识形态色彩，然而这种思维方法却让青年何祚庥“听了后大为佩服”，并且上升到了理论高度：“我们还是年轻，学马克思主义学得不好，学得不够深刻。”不久后的另一个事件，则直接促使何祚庥回到物理专业上。
当时两位苏联科学院院士宣称，发现了被称为“变子”的许多新粒子，这个发现使他们获得了斯大林奖金。那个时候崇尚学习苏联，苏联科学被认为水平很高，何况又是获得了权威的斯大林奖金的研究。
但前辈物理学家王淦昌对此不以为然，50年过去了，何祚庥至今还能清晰地记得王淦昌带着口音的普通话：“靠不住的，靠不住的。”对于前辈的否定，何祚庥嘴上没说什么，对王淦昌却有些腹诽：你看，资产阶级科学家——崇尚英美、反对苏联、轻视自己。
然而，以后的事实证明王淦昌是对的。何祚庥当时正积极学习马克思主义，但这件事情再次提醒他，他的马克思主义学习“在运用到具体工作的时候，必须结合实际，必须有具体知识”。何祚庥找到个合适的机会，又回到物理学。
后来就有了院士何祚庥。
张宝胜有没有特异功能？
上世纪80年代，何祚庥开始带头反对伪科学，他和当时号称“超人”的张宝胜当面较量，彻底戳穿了后者的把戏，这样的例子还有揭露“水变油”、严新“气功”。(本段提要)
1980年，何祚庥就当选中国科学院院士，而他更多地被公众瞩目，则开始于他反对伪科学。
实际上，本来科技人员对反伪科学并不在意：“反对伪科学对我们搞真科学没有什么好处，要浪费很多时间。”但1994年中央号召院士带头反对伪科学，何祚庥觉得“应该尽点责任”，没想到从此一发不可收。
其实在此之前，何祚庥已经和号称“超人”的张宝胜较量过。自称有特异功能的张宝胜当时大名鼎鼎，某电视台春节晚会连续八年请张宝胜坐在第一排，因为“如果得罪了他，他一发功造成断电，我们的节目就完蛋了”。
1988年，人体科学小组决定测试张宝胜的“穿壁现象”，就是说可以把药丸从药瓶里穿透出来。为了公正起见，人体科学小组请了何祚庥等10位“反对派”参加，并同意“反对派”自带样品测试。
“反对派”请中科院化学所吹玻璃的老师傅吹了五个形状古怪的玻璃瓶，每个瓶里放了3至5颗药丸。为了防止作弊，玻璃瓶封口时不用软木塞和蜡，而是烧结起来。这样，要打开瓶子，惟一办法是锯开，而玻璃锯开后想再焊上是不可能的。
张宝胜拿来瓶子看了两眼就放在桌上，开始泡蘑菇，从上午9点半一直磨蹭到12点。现场主持人鼓励他：你卖点力，快点弄出来。但这个力张宝胜怎么也卖不出来了。
12点半，大家问：是散会，还是怎么办？有人说各位忍耐一会儿，为科学献身一下，让张宝胜换个节目。就是把名片撕碎嚼烂，然后一拍就还原。有人递了张名片给张宝胜，何祚庥说：“先给我看一下。”拿过名片，何祚庥就在正反面都签上了自己的名字。
张宝胜一看，就说不想表演这个节目，改成用耳朵识字。何祚庥写了一句“一枝红杏出墙来”，放进信封封好后，又在所有接缝签上自己的名字，再用透明胶把封口和签名贴上。
张宝胜发了半天功，忽然把信封卷在钢笔上，让主持人拿着，说过一会儿有块糖会钻到信封里，然后上厕所去了。因为按照事先约定，样品不能带走，人可以出去。张宝胜不知道，何祚庥他们还请来了北京杂技团的4位魔术师。这时候，一位魔术师说，主持人能不能看看这个信封是不是何老师签名的那个信封？
展开一看，果然信封被掉了包，张宝胜的戏法彻底穿帮。
然而何祚庥发现，揭穿伪科学容易，让大家相信那是伪科学却十分困难。尽管张宝胜露了馅，1990年《奇人张宝胜》一书仍然大量公开发行，1991年电视剧《超人张宝胜》在很多电视台播出。在以后揭露“水变油”、严新“气功”，以及反对邱氏鼠药的过程中，这类情况是何祚庥经常面对的。
预测未来能源结构失误
2000年，何祚庥预测2050年中国能源的未来结构。然而几年后，何祚庥发现这个判断有失误。(本段提要)
第一次面对伪科学，还是青年何祚庥在中宣部工作的时候，那是很轻易的一次胜利。之所以给何祚庥留下印象，是因为主角是国民党高级将领黄维。
黄维在淮海战役被俘，关押在战犯改造所。接受改造时黄维表现积极，主动提交了一个可以发出能量的新发明。新发明方案被送到各个部门，但是没有人明白这个玩意儿。当时还没有国家科委、国防科委，中宣部科学卫生处是主管全国的科学工作的惟一机构，新发明最终送到了何祚庥手上。
何祚庥一看：“永动机！”黄维明明白白写着，不需要任何能量可以永远转动下去。这是无数关于“永动机”幻想中的一个小插曲，何祚庥的回复很简单，不符合能量守恒定律，没有什么价值。
不过，复杂的现实经常不是那么简单明了的。“年轻时社会科学的争论就不仅不是永远对，而且常常是错的。”何祚庥这么回顾自己的青年时代。在他指出黄维的常识性错误之后48年，他也有过失误。
2000年，社会上流行对21世纪的预测热。何祚庥做了一个谈话，是关于21世纪科技的10大预测。其中有一条是，到2050年，中国能源的未来结构大致是煤、水能、核能各占三分之一。
然而几年后，何祚庥发现这个判断有失误：“2000年我冒叫了一声。”随着重工业的发展，这些年能源高度紧张，能源需求增长比GDP快了很多。根据初步规划，2020年全国能源需求是12亿千瓦，到2050年肯定远远超过25亿千瓦，而水能资源能开发的只有5亿千瓦。何祚庥的另一个数据是，全国核能资源只能支撑50座标准核电站运转40年，是5000万千瓦，即使加上很多扩展核能资源的种种措施，也做不到三分之一；另外，加上种种措施后，会大幅度增加发电成本，没有市场竞争力。
何祚庥承认：“那个时候对2050年究竟需要多少能源心中不很有数……对国情还是了解不够。”不过，何祚庥观念调整很迅速，现在，他正大力呼吁发展风能、太阳能。
有人说何祚庥很坚持自己的观点，何祚庥纠正：“我不是坚持我的观点，而是我认为我的观点很正确。”曾经有某烟草公司邀请何祚庥等科技人员去参观访问，讨论烟草工业未来出路，照例讨论之后是去大理、丽江旅游。轮到何祚庥发言，何祚庥照样还是说烟草有害，危害健康。
何祚庥说中医是伪科学？
2004年，诺贝尔物理学奖获得者杨振宁提出，易经影响了中华文化的思维方式。这个论断掀起了轩然大波，但何祚庥力挺杨振宁。
敢于开口的作风，使何祚庥每每处于风口浪尖。
2004年9月的“2004文化高峰论坛”上，诺贝尔物理学奖获得者杨振宁提出，易经影响了中华文化的思维方式，而这个影响是近代科学没有在中国萌芽的重要原因之一。这个论断掀起了轩然大波，引发了激烈的讨论和对杨振宁的批评。一个月后，何祚庥在“全国第二届智慧学学术研讨会”上力挺杨振宁，认为在思想层面上，“易经的思维模式有两大明显的缺陷。一是宣扬神秘主义，二是美其名曰整体思维，其实是笼统思维”。何祚庥还以中医理论中的阴阳、五行理论作为典型例证，由此流传出“何祚庥说中医是伪科学”的传闻。但是，中医并不等于“‘阴阳五行’的理论”。
“人的认识不可能一下到位。”这是何祚庥对自己在未来能源结构上判断失误的总结，这似乎也适用于所有问题的争论。
何祚庥坚持认为，一种理论是否科学，要有严格的证明，或者用哲学科学家波普尔的说法，凡是不具有可证伪性的理论、观念，就是伪科学。
