不少公司毛利率与净利率相差甚大，而且波动非常明显
　　
　　毛利率较高的公司容易受资金的青睐，如4月16日以来，大盘跌去20%的同时，剔除ST类上市公司，毛利率排名最前的十家公司中，有七家公司表现强于大盘。但也有些公司在“暴利”的同时，却未必能有令人满意的表现。
　　这是因为毛利指的是营业收入与营业成本的差额，并没有计算相关费用以及税负等对业绩的影响，以及产品价格波动对公司毛利率的影响。
　　Wind统计显示，2009年毛利率高于50%的上市公司中有不少净利率小于10%，甚至为负。这些公司主要集中在房地产、信息技术、医药、旅游以及采掘等板块。代表的股票有天伦置业（000711.SZ）、海虹控股（000503.SZ）、中汇医药（000809.SZ）、北京旅游（000802.SZ）、西藏矿业（000762.SZ）等。
　　海虹控股就是一家毛利率与净利率相差甚大的典型软件公司。近三年来公司毛利率持续处于相对较高位置，在60%~82%范围内徘徊，但同时净利润率却始终保持在个位数，在2009年一季报、2008年中报公司净利润甚至出现亏损。
　　还有些软件公司季节间毛利率变化非常明显。
　　如华平股份(300074.SZ)主营业务是多媒体通信系统，去年年报毛利率为76%，净利润率为43%，而2010年一季报销售毛利率虽然上升至79.2%，而净利润率却降至5.43%。
　　无独有偶，主营业务是软件销售、硬件销售以及技术服务的久其软件（002279.SZ）2009年年报也颇为靓丽，毛利率为92%，净利润率为33%。但是2010年一季报其毛利率降至84.44%，净利润率竟为-46.46%。
　　某券商软件行业分析师向第一财经日报《财商》分析：“软件公司毛利率高、净利润率相对较低，主要是因为研发以及销售方面投入的费用会相对较高。”
　　对于营业外收入，上述分析师告诉记者：“公司营业外收入主要与政府补贴以及增值税退税有关，很多行业增值税退税可能占到净利润的20%~25%。”
　　对于一季度软件行业某些公司业绩相对较差的现象，该分析师表示：“软件行业一季度签了单子未必能反映在季报中，下半年的业绩会有所提升。”
　　此外，有色金属板块、医药板块等毛利率的参考价值也要打个问号。因为产品价格波动对此类公司收益影响非常大。
　　如健康元（600380.SH）的主要产品――7-ACA的价格2008年8月从750元/公斤一路走高至今年一季度的1000元/公斤，毛利率与净利润率也分别从2008年中报的48%、3.08%上升到今年一季报的57%、25.9%。
　　西藏矿业（000762.SZ）毛利率的波动性也很大，2008年中报公司毛利率还保持在46%左右。但是随着大宗商品价格的暴跌，2009年年初公司的毛利率跌至19%，但在2009年末公司毛利率又回到51%。
　　市场中还有一些公司虽然毛利率很高，但是由于投资收益占比较大，毛利率反映公司盈利能力的作用被钝化，因此要综合考虑投资标的物的收益情况。
　　如吉林敖东（000623.SZ）主营业务毛利率高达70%，净利润率为131%。但是公司营业收入很大程度上来自于对于股票基金投资。