新医改实施方案对医药行业的上游（药品生产企业）、中游（药品流通经营）和下游（城市医院、社区医院、农村医院三级医疗网络和零售药店）都将产生颠覆性的深刻变革，引领药品研发创新、药品价格、药品销售使用朝向科学合理有序竞争，医药行业内部洗牌和整合将有望逐步形成。
　　我们分析，新医改实施方案中长期利好八类企业，对应有八大投资主题：
　　1、受益于"中央政府承担对国家免疫规划、跨地区的重大传染疾病预防控制"政府采购的疫苗生产企业有：天坛生物、华兰生物。
　　2、"医保管办分开，医保支付改革"将有利于与进口药市场竞争、有性价比优势的专科药，相关受益公司有：恒瑞医药、通化东宝等。
　　3、"利用药品价格杠杆鼓励企业自主创新"将有利于具备自主创新研发新药的企业，相关受益公司有：恒瑞医药、天士力、华北制药等。
　　4、受益于"国家基本药物制度"、品牌和疗效突出的基本药物生产的相关公司有：东阿阿胶、天士力、云南白药、康美药业、千金药业、康缘药业、华北制药、同仁堂，金陵药业，天药股份，海正药业以及复星医药旗下江苏万邦等。