中信建投证券研究报告指出，背靠强大股东，公司长期估值可提升。公司背靠两大强力股东：医工院研发实力执药品开发领域牛耳，30多家上市公司都曾经接受其技术转让，包括恒瑞医药、华海药业、海正药业等国内领军企业，未来公司或将优先受让大股东研发成果，硬件平台大大改善后也将有能力实现其产业化；国药集团拥有最庞大的药品营销网络，有望为公司产品的销售提供渠道优势，从而弥补公司在药品营销方面的短板。公司大股东医工院并入国药集团后，集团公布了对现代制药清晰的定位——公司将致力于以非头孢类、非青霉素类药品为主攻方向，研究和生产有特色的原料药和制剂，沿既有的产品路线，大力拓展其它市场。
　　公司在海门基地投产及新制剂大楼投入使用后，制剂和原料药生产的硬件基础都将大大改观，作为工业及新产品产业化平台的条件也越来越成熟，也更有可能获得集团有利的整合计划支持。从国内其他两大医药巨头的动向看，国药旗下资产整合势在必行，需要的只是时间。
　　预计公司未来三年EPS分别为0.49、0.67和0.89元，考虑收购资产后净利润的增厚，产能瓶颈将得到解除，加之外延式扩张以及全国市场开拓的预期，公司未来较大概率出现加速增长的态势，提高公司评级至“买入”。